Нечаевская СОШ № 2 была открыта 1 сентября 1986 года. Школу приняла директор школы Ибрагимова П.И. не как отдельную школу, а как корпус к школе № 1. В 1987 г. директором школы от рай ОНО был назначен Убайдулаев А.Р., а Патимат И. вновь заняла свое место завуча. В 1988 г. директором назначается Гитиномагомедов Х.М. Под его руководством и по его настойчивости школа отделилась как 9-летняя школа. После окончания 9 кл. учащиеся переходили в среднюю школу № 1. С 6 декабря 2006 года директором школы назначается Гафуров М.М. Зам. дир по УВР работает Ибрагимов М.М., нач.шк Гаджиев Х.Х. С марта 2018 года директором школы был назначен Абдухаликов М.А.